UE1

ADMINISTRATION ET GESTION

D’UNE PLATE-FORME (30H)

Site : Université de Paris

• Outils d’administration d’une plate-forme

• Cahier des charges

• Tarification plate-forme

• Comptabilité générale et analytique

• Marchés publics

• Propriété intellectuelle

• Contrats

• Qualité

• Hygiène et sécurité

• Management

• Projet professionnel

• Thématiques de plate-forme

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UE2

FORMATION SCIENTIFIQUE PLURIDISCIPLINAIRE

COURS ET CONFÉRENCES (170 H)

Site : Université de Paris

BIOLOGIE

• Génomique (banques, séquençage haut débit, et outils d’analyse en génomique).

• Transcriptomique (puces, techniques PCR)

• Protéomique (spectrométrie de masse, biFC, FRET, BRET)

• Génétique (mutants, TILLING)

• Biotechnologies

• Biologie cellulaire (cycles cellulaires, marqueurs)

PHYSIQUE

• La lumière et ses propriétés

• La fluorescence

• Optique géométrique (image 3D), optique de Fourier.

• Instrumentations de l’optique

MATHÉMATIQUES

Mathématiques du signal : fonctions à plusieurs variables, dérivées, intégrales, convolution, transformées et filtrage, approximation polynomiale de fonctions discrètes.

BIOSTATISTIQUES

Analyse des données et les tests statistiques.

Introduction à la manipulation

de données massives

Fichiers informatiques, analyse de données de haut débit, traitement des données.

INFORMATIQUE

• Base de programmation

• Création de site web

• Python, R

UE3

FORMATION THÉORIQUE ET PRATIQUE

AUX TECHNOLOGIES (230H)

Site : Plates-formes franciliennes avec

intervenants professionnels

GÉNOMIQUE

Sites : Institut Cochin, Institut Curie

• Puces à ADN, transcriptome, PCR quantitative, NGS, qualité des échantillons, traitement des données

Production et caractérisation des protéines,

PROTÉOMIQUE

Sites : Institut Pasteur, Institut Jacques Monod

• Spectrométrie de masse (LC/MSMSMS, Orbitrap, méthode d’analyses)

• Production protéines recombinantes

• Cristallographie

IMAGERIE DU PETIT ANIMAL

Sites : Institut Cochin, Faculté de Chirurgie dentaire Montrouge, Faculté de Pharmacie Observatoire, Saints Pères, HEGP, Saint Louis

• Risques biologiques, échographie, iRPE, Scanner X,

bioluminescence, IRM

MICROSCOPIE ÉLECTRONIQUE

Sites : Institut Curie, Institut Pasteur

• Microscopie transmission, balayage, corrélative

• Ultracryomicrotome, immunomarquage

• Fixation chimique ou haute pression

MICROSCOPIE PHOTONIQUE

Sites : Institut Jacques Monod, Institut Cochin, Institut Curie

• Microscopie confocale, plein champ, TIRF, Multiphotons

• Super résolution (PALM STORM SIM STED) FRAP FRET FLIM SPIM

CYTOMÉTRIE

Sites : CNRS Gif-sur-Yvette, Institut Gustave Roussy, Institut Cochin

• Analyseur, trieur, immunomarquages multiples, Imagerie en flux, cytométrie sur microbilles, fluidique

TRAITEMENT ET ANALYSE D’IMAGES

Sites : Institut Jacques Monod, Institut Curie

• Image J, comptage, mesures, segmentation 2D, filtrages, analyses fréquentielles, transformation de Fourier, co-localisation, déconvolution, reconstructions et représentations 3D

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UE4

ANGLAIS (PRÉSENTATION EN ANGLAIS)

Site : Université de Paris

FORMATION EN ALTERNANCE 2 MOIS

EN ENTREPRISE, 2 MOIS EN FORMATION,

PENDANT UN AN