UE1
ADMINISTRATION ET GESTION
D’UNE PLATE-FORME (30H)
Site : Université Paris Cité
• Outils d’administration d’une plate-forme
• Cahier des charges
• Tarification plate-forme
• Comptabilité générale et analytique
• Marchés publics
• Propriété intellectuelle
• Contrats
• Qualité
• Hygiène et sécurité
• Management
• Projet professionnel
• Thématiques de plate-forme
UE2
FORMATION SCIENTIFIQUE PLURIDISCIPLINAIRE
COURS ET CONFÉRENCES (170 H)
Site : Université Paris Cité
BIOLOGIE
• Génomique (banques, séquençage haut débit, et outils d’analyse en génomique).
• Transcriptomique (puces, techniques PCR)
• Protéomique (spectrométrie de masse, biFC, FRET, BRET)
• Génétique (mutants, TILLING)
• Biotechnologies
• Biologie cellulaire (cycles cellulaires, marqueurs)
PHYSIQUE
• La lumière et ses propriétés
• La fluorescence
• Optique géométrique (image 3D), optique de Fourier.
• Instrumentations de l’optique
MATHÉMATIQUES
Mathématiques du signal : fonctions à plusieurs variables, dérivées, intégrales, convolution, transformées et filtrage, approximation polynomiale de fonctions discrètes.
BIOSTATISTIQUES
Analyse des données et les tests statistiques.
Introduction à la manipulation
de données massives
Fichiers informatiques, analyse de données de haut débit, traitement des données.
INFORMATIQUE
• Base de programmation
• Création de site web
• Python, R
UE3
FORMATION THÉORIQUE ET PRATIQUE
AUX TECHNOLOGIES (230H)
Site : Plates-formes franciliennes avec
intervenants professionnels
GÉNOMIQUE
Sites : Institut Cochin, Institut Curie
• Puces à ADN, transcriptome, PCR quantitative, NGS, qualité des échantillons, traitement des données
Production et caractérisation des protéines,
PROTÉOMIQUE
Sites : Institut Pasteur, Institut Jacques Monod
• Spectrométrie de masse (LC/MSMSMS, Orbitrap, méthode d’analyses)
• Production protéines recombinantes
• Cristallographie
IMAGERIE DU PETIT ANIMAL
Sites : Institut Cochin, Faculté de Chirurgie dentaire Montrouge, Faculté de Pharmacie Observatoire, Saints Pères, HEGP, Saint Louis
• Risques biologiques, échographie, iRPE, Scanner X,
bioluminescence, IRM
MICROSCOPIE ÉLECTRONIQUE
Sites : Institut Curie, Institut Pasteur
• Microscopie transmission, balayage, corrélative
• Ultracryomicrotome, immunomarquage
• Fixation chimique ou haute pression
MICROSCOPIE PHOTONIQUE
Sites : Institut Jacques Monod, Institut Cochin, Institut Curie
• Microscopie confocale, plein champ, TIRF, Multiphotons
• Super résolution (PALM STORM SIM STED) FRAP FRET FLIM SPIM
CYTOMÉTRIE
Sites : CNRS Gif-sur-Yvette, Institut Gustave Roussy, Institut Cochin
• Analyseur, trieur, immunomarquages multiples, Imagerie en flux, cytométrie sur microbilles, fluidique
TRAITEMENT ET ANALYSE D’IMAGES
Sites : Institut Jacques Monod, Institut Curie
• Image J, comptage, mesures, segmentation 2D, filtrages, analyses fréquentielles, transformation de Fourier, co-localisation, déconvolution, reconstructions et représentations 3D
UE4
ANGLAIS (PRÉSENTATION EN ANGLAIS)
Site : Université Paris Cité
FORMATION EN ALTERNANCE 2 MOIS
EN ENTREPRISE, 2 MOIS EN FORMATION,
PENDANT UN AN